تعاریف، برداشت­ها، ساختارها و سازوکارهای نوآوری و کارآفرینی در کشور ما، از زمان شکل‌گیری، دچار دگرگونی و بازبینی فراوانی شده است تا از این مسیر، مدل­های موجود به دستاوردهای عینی کارآمدتری تبدیل شوند. مدل ناحیه نوآوری دانشگاه اصفهان، همانند کارخانه‌های نوآوری تدوین شده است؛ به جای اینکه مراکز نوآوری با مدیریت دولتی و دانشگاهی در این ناحیه ایجاد شود، تلاش شده است تا در این ناحیه از مشارکت قوی بخش خصوصی استفاده شود تا هم چابکی و هزینه‌ی پایین‌تر در ارائه‌ی خدمات به استارتاپ‌ها محقق گردد و هم از توان و ظرفیت آکادمیک دانشگاهیان به نحو مؤثر استفاده شود. از این رهگذر است که ارتباط برد-برد معناداری بین دانشگاه و صنعت و جامعه حاصل می‌گردد. به این منظور، مجموعه‌های سرمایه‌گذار و صنایع بزرگ بخش خصوصی که تمایل به استقرار در این ناحیه و پروش و سرمایه‌گذاری روی استارتاپ‌های نوآفرین دارند، می‌بایست پیشنهادیه‌های خود را به شورای عالی نوآوری دانشگاه ارائه نمایند.